活动地点：50322

  活动时间：2023年11月16日（星期四）晚上 19：00

  报告人：邵成艳植物学2023级硕士

  报告主题：樟科新樟属7个分类群叶绿体全基因组的比较与系统发育分析

  内容简介：新樟属（Neocinnamomumis）被认为是樟科中最神秘的类群之一，主要分布在东南亚的热带和亚热带地区。该属含有珍贵的油籽和药用树种。然而，目前对新樟属的研究较少，其种间关系尚不清楚。为了探讨新樟属叶绿体基因组的基因结构和进化特征，解决属内的种间关系，对代表新樟属7个分类群的51个样品的叶绿体全基因组序列进行了比较基因组学和系统发育分析研究。新樟属叶绿体全基因组大小为150,753 ~ 150,956 bp，GC含量为38.8% ~ 38.9%。新樟属叶绿体基因组共注释了128个基因，其中蛋白编码基因84个，rRNA基因8个，tRNA基因36个。共检测到71 ~ 82个简单重复序列（SSRs），其中以A/T碱基重复序列最为常见。叶绿体基因组共包含31个优选密码子。trnN-GUU-ndhF， petA- psbJ，和 ccsA-ndhD三个高度可变区域的Pi值均 > 0.004。基于全叶绿体基因组系统发育树，确定了新樟属7个分类群的系统发育关系。